La mise en place d’un nouveau Conseil du SSATP et d’unenouvelle équipe de gestion en 2001 donnent l'opportunité d'initier une nouvelle phase dans le Deuxième Plan de Développement en accord avec le secteur des tranports en Afrique. Le rapport annuel 2011 pose les bases de nouvelles orientations stratégiques pour un programme plus réactif et mieux adapté ainsi que celles de la préparation d'un Troisième Plan de Développement.